生物多樣性管理區
此區受嚴謹的管理，主要用作進行生物多樣性的保護工作、教育及培訓活動。米埔自然保護區在此區域範圍內。
核心區
設立核心區的目的是保留一片不受騷擾的天然生境作參考對比。區內有開闊的海水生境、潮間帶泥灘、紅樹林及小片淡水生境。儘量保留區內天的然生態，除進行必須的管理、監察及研究工作，否則均不准進入。
私人土地區
拉姆薩爾濕地的範圍包括部分私人擁有的土地。私有土地不受管理計劃規管，但現有的規劃制度，限制大幅度更改這些土地的現行用途。
公眾參觀區
設立公眾參觀區的目的，是讓公眾能在妥善管理下，自由進入拉姆薩爾濕地部份範圍。此外，該區也是推行教育活動及提高公眾濕地保護意識的理想地點，讓公眾認識拉姆薩爾濕地的生態價值。
資源善用區
設立資源善用區的目的，是以符合可持續使用原則善用濕地及其他自然資源，配合拉姆薩爾濕地的管理宗旨及目標，及在適當情況下加以推廣。這個區域也具有緩衝作用，配合及補充拉姆薩爾濕地範圍外緩衝區的功能。
